Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NefhP19246 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NefhP19246 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NefhP19246 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NefhP19246 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms