Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18530 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P18530 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms