Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18529 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18529 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms