Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18528 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms