Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcnaP17918 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms