Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa-rs1P17533 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms