Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pou4f1P17208 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms