Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RhoP15409 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
RhoP15409 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RhoP15409 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RhoP15409 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RhoP15409 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RhoP15409 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms