Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrgnP13609 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms