Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxd3P09027 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxd3P09027 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxd3P09027 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxd3P09027 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxd3P09027 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxd3P09027 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxd3P09027 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxd3P09027 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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