Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TtrP07309 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
TtrP07309 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
TtrP07309 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
TtrP07309 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
TtrP07309 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
TtrP07309 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
TtrP07309 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
TtrP07309 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
TtrP07309 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
TtrP07309 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
TtrP07309 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
TtrP07309 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
TtrP07309 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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