Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PdgfrbP05622 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PdgfrbP05622 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PdgfrbP05622 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PdgfrbP05622 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PdgfrbP05622 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfrbP05622 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PdgfrbP05622 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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PdgfrbP05622 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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PdgfrbP05622 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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