Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CopeO89079 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CopeO89079 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CopeO89079 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CopeO89079 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CopeO89079 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CopeO89079 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CopeO89079 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CopeO89079 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CopeO89079 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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