Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms