Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Copb2O55029 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Copb2O55029 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Copb2O55029 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms