Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms