Protein–RNA interactions for Protein: O35295

Purb, Transcriptional activator protein Pur-beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PurbO35295 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PurbO35295 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PurbO35295 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PurbO35295 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PurbO35295 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PurbO35295 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PurbO35295 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms