Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ptpn9O35239 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ptpn9O35239 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ptpn9O35239 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ptpn9O35239 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ptpn9O35239 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ptpn9O35239 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ptpn9O35239 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ptpn9O35239 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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