Protein–RNA interactions for Protein: O09100

Gata2, Endothelial transcription factor GATA-2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata2O09100 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata2O09100 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata2O09100 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata2O09100 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata2O09100 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms