Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Smim18J3QNP2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms