Protein–RNA interactions for Protein: J3QN86

Gm21882, Predicted gene, 21882, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21882J3QN86 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21882J3QN86 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms