Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms