Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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