Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms