Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rarres1F6ZIS7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rarres1F6ZIS7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms