Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Igkv1-99F6XWB2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Igkv1-99F6XWB2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms