Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC067074F6RXI4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC067074F6RXI4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BC067074F6RXI4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC067074F6RXI4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC067074F6RXI4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC067074F6RXI4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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BC067074F6RXI4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BC067074F6RXI4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BC067074F6RXI4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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BC067074F6RXI4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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BC067074F6RXI4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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BC067074F6RXI4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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BC067074F6RXI4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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BC067074F6RXI4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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