Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Parp4E9PYK3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms