Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms