Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms