Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms