Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms