Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms