Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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