Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Phf11bB4XVQ1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Phf11bB4XVQ1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Phf11bB4XVQ1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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Phf11bB4XVQ1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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