Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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