Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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