Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms