Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms