Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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