Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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