Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms