Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms