Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms