Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Gm17190V9GX38 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Gm17190V9GX38 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
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Gm17190V9GX38 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Gm17190V9GX38 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Gm17190V9GX38 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm17190V9GX38 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm17190V9GX38 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm17190V9GX38 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17190V9GX38 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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