Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm26992S4R1A3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms