Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms