Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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