Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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