Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ntn3Q9R1A3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ntn3Q9R1A3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ntn3Q9R1A3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ntn3Q9R1A3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ntn3Q9R1A3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ntn3Q9R1A3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ntn3Q9R1A3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ntn3Q9R1A3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ntn3Q9R1A3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ntn3Q9R1A3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ntn3Q9R1A3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms